|
Mikrobiyoloji
laboratuarında biyogüvenlik......................... 1
Mikrobiyoloji
laboratuarlarında kullanılan güvenlik kabinleri.. 3
Sınıf I güvenlik
kabini................................................. 3
Sınıf II güvenlik
kabini................................................ 4
Sınıf III güvenlik
kabini............................................... 5
Kalite Güvencesi (Quality
Assurance).............................. 6
GLP (Good
Laboratory Practice).................................... 8
GMP (Good
Manufacturing Practice)................................ 8
Bakteriyoloji
Laboratuarında Kullanılan Malzemeler............. 9
Bakteriyoloji
Laboratuarında Kullanılan Cam Malzemenin Temizliği ve
Yeniden
Kullanılması için Hazırlanması............................ 9
Mikroskoplar.............................................................
10
Mikroorganizmaları
Öldürmede Kullanılan Yöntemler........... 12
Kimyasal
Yöntemler................................................... 13
Fiziksel
Yöntemler......................................................
13
Yakma ile
Sterilizasyon............................................... 13
Kuru Hava ile
Sterilizasyon.......................................... 13
Nemli İsı ile
Sterilizasyon............................................ 15
Basınçlı Buhar ile
Sterilizasyon...................................... 15
Tındalizasyon............................................................
16
Ultraviyole Işık
(UV)................................................... 17
İyonize Radyasyon
(İR)............................................... 17
Pastörizasyon............................................................
17
Filtrasyon................................................................
18
Saniîasyon...............................................................
18
Mikroorganizmaların
Üretildiği Canlı Ve Cansız Ortamlar...... 19
Canlı
Ortamlar..........................................................
19
Deney
Hayvanları......................................................
19
Embriyolu/Döletli
Yumurta........................................... 20
Doku
Kültürleri..........................................................
20
Cansız
Ortamlar........................................................
20
Besi Yeri
Hazırlama.................................................... 22
Kanlı
Ağar................................................................
22
Üremeyi Etkileyen
Çevresel Faktörler.............................. 27
Evcil Hayvanlarda
Mikrobiyel Flora................................. 33
Ağız ve
Nazofarinks....................................................
33
Jejunum ve
İleum...................................................... 33
Kalın
Barsaklar..........................................................
34
Üst Solunum
Yolları.................................................... 34
Vulva......................................................................
34
Vagina....................................................................
34
Den........................................................................
34
Bakteriyel
Enfeksiyonların Laboratuar Tanısı..................... 35
Marazi Madde Alma
ve Laboratuara Gönderme.................. 35
Süt........................................................................
36
Abort
materyali.........................................................
37
Sıvap......................................................................
39
Scrvikovaginal
mukus................................................. 39
Dışkı......................................................................
40
Patojen
Bakterilerin İdentifikasyonu................................ 40
Boyama..................................................................
40
Kültür.....................................................................
41
İdrar
Kültürü.............................................................
44
Kan
Kültürü..............................................................
45
Biyokimyasal
Özellikler............................................... 46
Anaerobik Kültür
için Marazi Madde Alımı......................... 46
Anaerobik
Enfeksiyon Şüpheli Marazi Maddenin Mikroskopisi 47
Clostridial
Enfeksiyonlar (Blackleg, malignant ödem vb)...... 48
Enterotoksemi...........................................................
48
Campylobacteriosis
(Sığır ve koyun)............................... 48
Antraks...................................................................
48
Hayvan Türlerine
göre Patojen ve Potansiyel Patojenlerin Dağılımı 48
Solunum
Sistemi.......................................................
49
Köpeklerde Deri
Enfeksiyonlarından İzole Edilen Mikroorganizmalar 50
Mide-Barsak Sistemi
Enfeksiyonlarından İzole Edilen Mikroorganizmalar 50
Deri ve Deri Altı
Dokularda Oluşan Ülser ve Abselerden İzole Edilen
Mikroorganizmalar 50
Genital
Enfeksiyonlardan İzole Edilen Mikroorganizmalar...... 51
Mastitis
Etkenleri.......................................................
52
Merkezi Sinir
Sisteminden İzole Edilen Mikroorganizmalar.... 53
Üıiner Sistem
Enfeksiyonlarından izole Edilen Mikroorganizmalar 53
Eklemlerden İzole
Edilen Mikroorganizmalar...................... 54
Otitise Sebep Olan
Etkenler.......................................... 54
Serviksten İzole
Edilen Mikroorganizmalar........................ 54
Göz
Enfeksiyonlarından İzole Edilen Bakteriler................... 55
Laboratuar
Hayvanlarından İzoie Edilen Bakteriler.............. 55
Bakteri Sayım
Teknikleri............................................. 56
Doğrudan
Mikroskobik Sayım........................................ 56
Canlı Bakteri Sayım
Tekniği......................................... 56
Bulanıklık
(Türbidimetrik) Yöntemi................................. 58
Preparat
Hazırlanması ve Boyama Yöntemleri................... 59
Kültürden Preparat
Hazırlama....................................... 59
Dokudan Preparat
Hazırlama........................................ 60
Boyama..................................................................
60
Bazik
Boyalar...........................................................
61
Asidik
Boyalar...........................................................
61
Basit
Boyama...........................................................
62
Kan
Frotısı...............................................................
64
Bileşik
Boyama.........................................................
64
Gram
Boyama..........................................................
65
Modifiye Gram
Boyama Yöntemi (Hucker Modifikasyonu)..... 66
Gram Boyama
Yönteminde Dikkat Edilecek Hususlar.......... 67
Asit-Fast Boyama
(Ziehl-Neelsen Boyama)...................... 70
Kapsül
Boyama.........................................................
71
Maneval'ın Kapsül
Boyama Yöntemi................................ 71
Giemsa Boyama
Yöntemi ile Kapsül Muayenesi................. 72
Endospor Boyama
(Schaeffer ve Fulton Yöntemi)............... 72
Mantar
Boyama.........................................................
73
Flagella
Boyama........................................................
74
Spiroketa Boyanması
(Fontana Yöntemi)......................... 75
İnklüzyon (Volutin)
Cisimciklerinin Boyanması.................. 75
Mikroorganizmalarda
Hareket Muayenesi.......................... 75
Lam-Lamel Arası
Muayene........................................... 77
Asılı Damla Tekniği
ile Hareket Muayenesi....................... 78
Anaerob
Mikroorganizmalar için Hareket Muayenesi............ 80
Bakteri
identıfıkasyonunda Kullanılan Testler.................... 80
Biyokimyasal
Testler ve Sınıflandırılmaları....................... 80
Karbohidrat
Metabolizması ile ilgili Testler........................ 80
Karbohidratların
Fermentasyon ile Parçalanması................ 80
Glukoz (veya diğer
şekerlerin) Fermentasyonu.................. 81
Metil Red (MR)
Testi................................................... 82
Voges-Proskauer(VP)
Testi........................................... 82
Karbohidratların
Solunum (Respirasyon) ile Parçalanması..... 84
Oksidasyon/Fermentasyon (O/F) (Oksferm) Testi.............. 84
Stafilokoklar ve
Mikrokoklar için Oksidasyon/Fermentasyon testi (Baird-
Parker
Modifikasyonu).................................................
85
Oksidaz (Sitokrom
Oksidaz ) Testi................................. 85
Katafaz
Testi............................................................
86
Nitrat İndirgenme
Testi............................................... 87
Amino Asit
Metabolizması İle İlgili Testler........................ 88
Indol
Üretimi............................................................
88
H2S
Üretimi.............................................................
89
Lizın Dekarboksilaz
Testi............................................. 90
Fenilalanin
Deaminaz Testi........................................... 92
Diğer Biyokimyasal
Testler........................................... 93
Sitrat Kullanım
Testi................................................... 93
Jelatin Hidroliz
Testi................................................... 93
Üre Hidrolizi
(Üreaz) Testi............................................ 94
ONPG
Testi..............................................................
95
CAMP
Testi...............................................................
96
Hemoliz
Testi...........................................................
96
Koagülaz
Testi..........................................................
97
Lamda Koagülaz
testi (Bağlı Koagülaz Aktivitesinin Ölçümü) 97
Tüpte Koagülaz
Testi (Serbest Koagülaz Aktivitesinin Ölçümü) 97
Beta Laktamaz
Testi................................................... 98
DNA'nın Hidrolizi
(Dnase Testi)..................................... 98
Nişasta Hidroliz
Testi.................................................. 99
Eskülin Hidrolizi
Testi.................................................. 100
Amonyak
Testi..........................................................
100
Arjinin Hidrolizi
Testi.................................................. 101
Kazein Hidrolizi
Testi.................................................. 102
Glükonat Oksidasyon
Testi........................................... 102
Hippurat Hidrolizi
Testi................................................ 103
Lesitinaz
Testi...........................................................
103
Levan Üretimi
Testi.................................................... 104
Lipolitik Aktivite
Testi................................................. 104
Malonat
Testi............................................................
104
Optokin
Testi............................................................
104
Fosfataz
Testi...........................................................
105
Proleoliz
Testi...........................................................
105
Sültataz
Testi...........................................................
105
Tellürit İndirgeme
Testi............................................... 106
Tween Hidroliz
Testi................................................... 106
Niasin
Testi..............................................................
106
Gram Negatif
Basillerin İdentifikasyonunda 3'lü Tüp Yöntemi 107
3'lü Tüp Yönteminin
Avantajları ve Dezavantajları.............. 109
Bakteri
İdentifikasyonunda Kullanılan Diğer Teknikler ve Testler 109
İmmünolojik
Teknikler................................................ 109
Faj
Tiplendirme.........................................................
109
Moleküler
Teknikler....................................................
110
Antibiyotik
Duyarlılık Testler!........................................ 112
Disk Diffüzyon
Yöntemi ile Antibiyotik Duyarlılığının Belirlenmesi 112
Bakteri Kültürünün
Hazırlanması ve Testin Yapılışı.............. 112
Laboratuar
Çalışmalarında Kullanılacak Su ve Özellikleri...... 114
Suyun Saflık
Dereceleri............................................... 114
Tip I
Su...................................................................
114
Tip II
Su..................................................................
114
Tip III
Su.................................................................
115
Saf Su
Eldesi............................................................
115
Deıyonize
Su............................................................
115
Dıstile
Su................................................................
115
Çift
Distilasyon.........................................................
116
Ekler......................................................................
117
Uygulamalar.............................................................
126
Genel Mikrobiyoloji
Uygulama Programı........................... 127
1 .Uygulama:
Laboratuarların Tanıtımı, Mikroskop Kullanımı ve
Prensipleri,
Biyolojik Tehlike ve Çalışma Kuralları.............. 127
2.Uygulama:
Sterilizasyon Teknikleri.............................. 128
3.Uygulama:
Preparat Hazırlama (Ağar, buyyon kültürlerinden ve
dokudan); ekim
teknikleri (seyreltme tekniği, dik ağara ekim vb) 129
4.Uygulama: Bakteri
Morfolojisinin Muayenesi (Makroskopik ve
mikroskobik
muayeneler), Basit Boyama Uygulamaları....... 130
5.Uygulama: Bileşik
Boyamalar ve Gram Boyama Uygulamaları 131
6.Uygulama:
Ziehl-Neelsen Boyama............................... 132
7.Uygulama: Kapsül
Boyama. Endospor Muayenesi............. 133
8.Uygulama: Negatif
Boyama....................................... 135
9.Uygulama:
Bakterilerin Üretildiği Ortamların Tanıtımı, Katı ve Sıvı Besi
Yerlerinin
Hazırlanması, Bakteri Ekim Teknikleri................ 136
10.Uygulama:
Anaerobiosis ve Mikroaerobiozis.................. 138
11.Uygulama:
Bakterilerde Hareket Muayenesi Teknikleri.... 139
12.Uygulama: Mantar
Besi Yerleri ve Mantar Boyama......... 140
13.Uygulama:
Bakteri Sayım Teknikleri........................... 141
14.Uygulama:
Fenotipik Varyasyon (Serratia marcescens pigment
üretimi/Staphylococcus aureus pigment üretimi ile)............
142
15.Uygulama:
Dezenfektanların Patojenler Üzerine Etkisi (Fenol
Koefisienti -FK-
uygulaması)........................................ 143
Özel Mikrobiyoloji
Uygulama Programı............................. 144
1.Uygulama: Bakteri
identifikasyonun Esaslarına Giriş, Katalaz Testi
(lamda ve
tüpte).......................................................
144
2.Uygulama:
Koagülaz Testi (lamda ve tüpte).................. 145
3.Uygulama: Oksıdaz
Testi, indol Testi............................ 146
4. Uygulama:
Karbohidrat Fermentasyon Testleri............... 147
5.Uygulama: Üçlü
Tüp Yöntemi..................................... 148
6.Uygulama: CAMP
Testi............................................. 149
7.Uygulama: Voges
Praskauer Testi, H2S testi.................. 150
8. Uygulama:
identifikasyonda Kullanılan Kitîerin (API vs) Tanıtımı ve
Çalışma
Prensipleri.....................................................
151
9.Uygulama:
Antibiyogram ve Yorumlanması.................... 152
10. Uygulama:
Nitrat Redüksiyon Testi........................... 153
11.UYGULAMA:
Somatik Hücre Sayımı ve Yorumlanması..... 154
12.UYGULAMA:
Mikrobıyal Sinerjızm............................... 155
13.UYGULAMA:
Bakteri Genetiği Uygulamaları 1 (Bakteri kromozomu
ekstraksiyon
yöntemleri)............................................. 156
14. ve 15.
Uygulamalar: Bakteri Genetiği Uygulamaları II; Poiimeraz
Zincir Reaksiyonu (PZR).............................................
157
Kaynaklar................................................................
159
Dizin......................................................................
164 |