Kitabın Adı: BİYOKİMYA (6. baskı) KİTABI |
|||||||||||||||||||||||
|
Veteriner Fakültelerine yönelik Ders Kitabıdır.
İÇİNDEKİLER
BİYOFİZİKSEL KİMYA 1
1.1. ATOMUN YAPISr VE İZOTOPLAR 1
1.1.1. Kimyasal bağlar 4
1.2. RADYOAKTİVİTE 8
Radyoaktif parçalanma hızı 10
Radyoaktivite ünitesi 11
Radyoizotopların kullanımı 11
Radyasyonun canlıdaki zararları 12
1.3. SU VE SULU ÇÖZELTİLERİN ÖZELLİKLERİ 12
Su molekülü polardır 13
Su kolaylıkla hidrojen bağları oluşturur 16
İyonlar suyun yapısını değiştirir 17
Nonpolar moleküller suda insolubl'dur 18
Suyun iyonizasyonu 19
Suyun iyonizasyon ürünleri: pH skalası 21
1.4. PH'NİN BELİRLENMESİ 23
Elektrom e trik metot 23
Kolorimetrik Metot 24
1.5. ASİTLER VE BAZLAR ' 25
1.5.1. Tamponlar 29
BİYOELEMENTLER 35
2.1. KALSİYUM VE FOSFOR 35
2.1.1. Hipokalsemi (Süt humması, Dana humması) 37
2.1.2 Hiperkalsemi 37
MAGNEZYUM 38
MİNERAL METABOLİZMASINI DÜZENLEYEN HORMONLAR 40
SODYUM (NA), POTASYUM (K), KLOR (CL) 41
ÇİNKO(ZN) 43
BAKIR 44
MANGANEZ (MN) 47
MOLİBDEN <MO) 47
SELENYUM (SE) 48
KOBALT (CO) 49
FLOR (F) 50
DEMİR (FE) 5Ü
2.13-KROM (CR) 51
KÜKÜRT (S) 52
İYOT (!) 52
PROTEİNLER 55
3.1. AMİNO ASİTLER 55
Protein yapı taşları olarak amino asitler 55
Proteinlerin yıkımlanmasının önemli temsilcileri 55
Amino asitlerin isimlendırilmeleri ve kimyasal yapıları 57
Amino asitlerin dipol yapıları 58
Amino asitlerin genel reaksiyonları 60
Amino asitlerin varlığının saptanması ve ayrımlanması 61
3.2. PEPTİTBAĞ1 VE PEPTİTLER 62
Peptitlerin amino asit sekansının saptanması 62
Peptit sentezi 63
Doğal peptitler 63
Peptiflerin biyosentezi ı 63
Peptit hormonlar '. 64
3.3. PROTEİNLER 66
Globuleryada spheroproteinier : 67
Fibriler proteinler 67
Proteidler 68
Proteinlerin nitelikleri 68
Proteinlerin çözünürlükleri 69
Denatürasyon 69
3.4. PROTEİN MOLEKÜLÜNÜN YAPISI 69
Primer yapı (Amino asit sekansı) 69
İkincil yapı (Zincir kon formasyonu) 70
Globüler proteinlerin üçüncül yapıları ...73
Protein molekülünün dördüncül yapısı 74
NÜKLEİK ASİTLER 75
4.1.NÜKLEOZÎDLERVENÜKLEOTİDLER 75
Nükleozidlerin ve nükleotidlerin yapı taşları 75
Nükleozitlerin ve mononükleotidlerin yapıları 77
Biyolojik açıdan önemli nükleozitler ve nükleotidler 79
Biyosentcz olaylarında nükleotidlerin önemi 81
4.2. POLİNÜKLEOTİDLER (NÜKLEİK ASİTLER) 81
Nükleik asitlerin primer yapıları 81
Nükleik asitlerin kon formasyon lan 83
4.3. NÜKLEİK ASİTLERİN METABOLİZMASI VE FONKSİYONLARI 87
Moleküler biyolojinin temeli 88
DNA'da bilgi depolanmasının prensibi ..88
4.4. REPLİKASYON 89
Replikasyonun genel prensibi 89
DNA polimerazlar: 90
DNA bozukluklarının enzim atik tamiri 94
Mitokondriyal DNA 95
RNA'dan DNA biyosentezi 96
DNA'nın kimyasal modifikasyonu 96
Prokaryotlarda kromozom yapısı ve DNA'nın replikasyonu: 96
Ökaryotlarda DNA replikasyonu ve kromozom yapısı 97
Repükasyon kesesi yardımıyla ökaryot genlerinin replikasyonu 98
4.4.10. Replikasyonun regülasyonu 99
4.5. TRANSKRİPSİYON 100
Prokaryotlarda transkripsiyon 102
Ökaryotlarda transkripsiyon 103
Prokaryotlarda RNA'nın posltranskripsiyonel modifikasyonu 104
Ökaryotlann primer transkripsiyon
ürünlerinin
posttranskripsiyonelmodifıkasyonlan: 105
Replikasyon ve transkripsiyon engelleyici maddelerin deneysel
ve klinik önemleri 106
4.6. GEN EKSPRESYONU : 107
Prokaryotlarda gen ekspres yon unun regülasyonu 107
Ökaryotlarda gen e xpre s yon unun regülasyonu 108
Evrim sırasında gen ekspres yon un un değişimleri 109
Farklılaşmış hücrelerde gen ekspresyonunun regülasyonu 111
GEN GRUPLARININ AKTARILMASI 112
PROKARYOT GENLERİNİN FARKLILAŞMASI 112
İki bakteri arasındaki genlerin aktarılması 112
Transpozisyonla genetik materyalin taşınması 113
Ökaryotlarda genlerin aktarılması 113
4.9. PROTEİN BİOSENTEZİ -TRANS LAS YON 114
Protein biosentezinin mekanizması 114
Kodlama alfabesi 114
Ribozomlarda genetik bilginin translasyonu 117
Protein biosentezi atölyesi (Ribozomlar) 117
Protein biosentezi aşamaları 118
Protein biyosentezinin spesifitesi 121
Poliribozomlar(Poli-yadaergozomlar) 122
Posttranslasyonel modifikasyonlar 122
Protein biyosentezinin enerji ve zaman gereksinimi 123
Sentezlenen proteinlerin salgılanması 123
Protein biosentezini engelleyen maddelerin klinik ve deneysel önemleri 123
Translasyonun regülasyonu 126
PROTEİNLERİN YIKIMLANMASI(PROTEOLİZ) 127
VİRUSLAR 127
Virusların spesifitesi 128
Virusların üremesi 129
Akut ve kalıcı virus enfeksiyonları 130
Virus enfeksiyonlarına karşı organizmanın savunma sistemleri 130
Virus enfeksiyonlarının tedavisi 132
Virus enfeksiyonlarında kemoterapi 133
Fajlarda lizojeni 134
Tümör vİrusları 135
Prionlar 140
KARBONHİDRATLAR 141
5.1. SINIFLANDIRMA 142
Karbon atomu sayısına göre 142
Moleküldeki basit şeker ünitesi sayısına göre 142
5.2. MONOSAKKARİTLER 144
S tere o izomer izm 144
Monosakkaritlerin anomerik şekilleri 147
Monosakkaritlerin Haworth formülleri 149
Monosakkaritlerin asit ve bazlarla reaksiyonları 131
Monosakkaritlerin Önemli Türevleri 153
DİSAKKARİDLER 159
TRİSAKKARİDLER 162
POLİSAKKARİDLER : 162
5.5.1. Depopolisakkaritler '. 163
5.5.2.Yapısal polisakkaritler 165
GLİKOPROTEİNLER 168
GLİKOLİPİTLER ■. 170
LİPİDLER 173
6.1. YAĞ ASİTLERİ 176
Yağ asitlerinin sınıflandırılması 179
Değişik zincir uzunluğundaki yağ asitleri ve doymamışhğin derecesi 180
Esansiyel yağ asitleri 181
Yağ asitlerinin kimyasal özellikleri 18i
Deterjanlar , 183
6.2. YAĞ ASİTLERİNİN GLİSEROLLE YAPTIKLARI BİLEŞİKLER 183
Nötral yağlar 183
Fosfolipidlcr 193
6.2.2. Difosfatidilgliseroller ve fosfoinozitidler 197
6.3. GLİSERİN TAŞIMAYAN LİPİDLER 198
Sfingolipidler 198
Alifaiik alkoller ve mumlar 201
TÜREV LİPİDLER 208
BİYOLOJİK ÖNEMİ OLAN DİĞER LİPİDLER 208
Eikozonoidler 208
Lipoproteinlerle taşınan bazı lipidler 209
Lisoibsfogliseridler 209
6.6. BİYOLOJİK ZARLAR 210
ENZİMLER 213
ENZİMLERİN GENEL ÖZELLİKLERİ VE YAPILARI 213
ENZİMLERİN AKTİF MERKEZİ 216
ENZİMLERİN LÖKASYONU 217
KATALİZÖRLERİN AKTİVASYON ENERJİSİ ÜZERİNE ETKİSİ 217
7.5. ENZİMLERİN SINIFLANDIRILMASI VE İSİMLENDİRİLMESİ 218
7.5.1. Oksidoredüktazlar 218
7.5.2.Transferazlar 220
Hidrolazlar 221
Liyazlar 222
İzomerazla 223
Ligazlar 223
7.6. ENZİM KİNETİĞİNİN PRENSİPLERİ 224
Michaelİs-Menten denklemi 224
Km'nin önemi 230
İki substratli reaksiyonlar 232
Cleland işaretle gösterme sistemi 234
7.7. ENZİMATİK AKTİVİTEYİ ETKİLEYEN FAKTÖRLER 235
Substrat konsantrasyonu. 235
Esi 235
Zaman 235
pH : 235
İnhibitörler 235
7.8. ENZİM AKTİVİTESİNİN KONTROLÜ 238
Allosterik enzimler 238
Kovalan modifikasyonla aklivasyon 241
7.9. PREENZİMLER (PROENZİMLER VEYA ZİMOGENLER) 242
İZOENZİMLER 242
ENZİM ÜNİTELERİ 243
ENZİMATÎK ANALİZLER İÇİN NUMUNE SEÇİMİ VE İŞLENMESİ 243
ENZİMATİK ANALİZLERİN PRENSİPLERİ 244
TIPTA ENZİMOLOIİDEN YARARLANILMASI 245
ENZİMLERİN ENDÜSTRİDE KULLANILMASI 246
KOENZİMLER 249
METABOLİT KOENZİMLER 249
VİTAMİNLERDEN KAYNAKLANAN KOENZİMLER 251
NAD' veNADP+ 252
FAD ve FMN 253
Tiyamin pirofosfat 254
Pridoksal fosfat 255
8.2.5 Biotin 256
Tetrahidrofolat 258
Koenzim A 259
Adenozil kobalamin ve metil kobaiamin 260
LİPOİK ASİT 261
UBİKİNON 262
BAZI AMİNOASİT ARTIKLARININ MODİFİYE
OLMASIYLA MEYDANA GELEN PROSTETİK GRUPLAR 262
8.6. KOENZİM OLARAK KABUL EDİLEBİLEN GRUP
TRANSFER PROTEİNLERİ 263
VİTAMİNLER 265
VİTAMİNLERİN SINIFLANDIRILMASI 266
VİTAMİNLERİN ADLANDIRILMASI 268
YAĞDA ERİYEN VİTAMİNLER 268
Vitamin A (retinol, akseroftol, epitel koruyucu, antienfeksiyöz vitamin). 268
Vitamin D (Kalsiferoi, anüraşitik vitamin) 274
9.3.3.VitaminE{TokoferoI) 277
9.3.4. Vitamin K (Antıhemorajik vitamin, fîllokinon, koagulasyon vitamini)....280
9.4. SUDA ERİYEN VİTAMİNLER 282
9.4.1. B Grubu vitaminler 282
9.5. VİTAMİN BENZERİ ETKİ YAPAN MADDELER 302
Mesoinosit (Miyoinosit) 302
Kamitin (Vitamin T) 303
Esansİyel Yağ Asitleri (Vitamin F) 303
HORMONLAR 305
ÜREME ÜZERİNE ETKİLERİ 306
BÜYÜME VE GELİŞME 306
METABOLİZMANIN SÜRDÜRÜLMESİ VE DİĞER GÖREVLERİ 307
HORMONLAR ARASI İLİŞKİLER 307
Tek hormonun çok yönlü fonksiyonları ; 307
Çok hormonun tek yönlü fonksiyonları 307
HORMONLARIN GENEL ÖZELLİKLERİ 307
SENTEZ 308
Peptit hormonlar 308
Steroid hormon sentezi 308
KANDA TAŞINMA 312
HORMONLARDA FEEDBACK KONTROL 312
ENDOKRİN SİSTEM PATOLOJİSİ 314
HORMON-RESEPTÖR İLİŞKİSİ 315
HORMONLARIN ETKİ MEKANİZMALARI 316
Peptit hormonların etki mekanizması 316
Steroid hormonların etki mekanizması 319
10.12. HORMONLARIN SINIFLANDIRILMASI 320
Kimyasal özeliklerine göre 321
Sentezlendikleri dokulara göre 321
PROTEİN, PEPTİT VE AMİNO ASİTLERİN
YIKILIMLARI VE
REZORPSİYONLARI 343
11.1. PROTEİN SİNDİRİMİ 343
Midede protein sindirimi 343
Barsaklarda Protein Sindirimi 344
11.2. PEPTİTLERİN VE AMİNO ASİTLERİN EMİLİMLERİ 345
Peptitlerin emilimi 345
Amino Asitlerin Emilimleri 345
11.3. AMİNO ASİT METABOLİZMASI 346
Amino asitlerin fonksiyonları 346
Günlük Amino Asil Metabolizması 346
Amino asit metabolizmasında karaciğer 347
İntramoleküler amino asit metabolizması 349
Amino asit metabolizmasında koenzim olarak piridoksal fosfatın önemi35O
Sııbstitiisyon reaksiyonları 350
11.4. AMONYAK METABOLİZMASI 352
Amonyağın toksisitesi 354
Am on yak-amonyum sistemi 354
Kanın amonyak içeriği 355
Amonyağın bağlanması 355
11.5. AMİNO ASİTLERİN AMİNO GRUPLARININ METABOLİZMASI 356
11.5.1. Amino gruplarının.taşınması 357
11.6. ASPARTAT SİKLUSU REAKSİYONLARI 358
AMİNO ASİTLERDEN VE DİĞER AZOT İÇEREN
BİLEŞİKLERDEN
AMONYAĞIN SERBEST HALE GEÇİRİLMESİ 359
DEHİDROJENİZASYONLA BAĞLANTILI OLMAYAN
DEZAMİNASYON 359
ASPARTİK ASİT SİKLUSU YARDIMI İLE AMONYAĞIN
SERBEST BIRAKILMASI 359
11.10. KANDA AMİNO GRUPLARININ TAŞINMASI 360
11.11.KARACİĞER, BEYİN VE BÖBREKLERDE
AMONYAK
METABOLİZMASI 362
Evrimin oluşumunda üre sentezinin gelişimi 362
Üre sentezi basamakları 362
Üre sentezinin kapasitesi 363
Karaciğer hücrelerinde üre siklusu enzimlerinin dağılımları 363
Karbomii fosfatın üreye dönüşümü 363
Sitozoldeki enzimatik basamaklar 364
Amonyağın zehirsiz hale geiirümesinin intrahepatik koordinasyonu.... 364
GI utanı i naz reaksiyonunun önemi 364
Ekstrahepatik üre sentezi 365
Üre sentezinin enerji blançosu 366
Üre sentezinin kontrolü 366
11.12. AMİNO ASİT METABOLİZMASI 366
Esansiyel amino asitler 366
Mikroorganizmalarda ve bitkilerde amino asit sentezi 367
Esansiyel amino asitlerin hayvansal
organizmada
sentezlenememesinin nedenleri 368
Esansiyel amino asitlerin yıkılımları ve metabolik önemleri 368
Katabolik enzimlerin lokalizasyonu ve yıkılım regülasyonu 370
Organizmada amino asitlerin yer değiştirmesi 370
Esansiyel olmayan amino asitler 37!
11.13. HEM VE SAFRA RENKLİ MADDELERİ 375
11.13.1. Porfirinlerin yapılan ve fonksiyonları -. 375
Hem biyosentezi 375
Safra renkli maddelerin yıkılımları 378
Kandaki bilirubin'in gösterilmesi metotları 381
Bilirubin'in toksisitesi 381
Barsaklarda bilirubin yıkılımı 381
Entero hep atik dolaşım 383
Hemoglobin ve hetn'in kan'da taşınması 383
Katabolize edilen hemoglobin ve bilirubin miktarı 383
11.13.10. Patobiyokimyası 383
KARBONHİDRAT METABOLİZMASI 387
12.1. SİNDİRİM VE EMİLİM 387
Polisakkaritlerİn sindirimi 388
Disakkaritlerin sindirimi 388
12.2-GLİKOZ METABOLİZMASI ; 392
Glikozun hücrelere girişi ve fosforilasyon 393
Glikozun direkt oksidasyonu : 400
12.3. DİĞER MONOSAKKARÎTLER VE RUMİNANTLARDA
UYA'LERİ METABOLİZMASI 412
Fruktoz metabolizması 412
Galaktoz metabolizması 414
M an no z metabolizması 414
UYA'leri metabolizması İ...414
12.4. TRİKARBOKSİLİK (SİTRİK ASİT) ASİT DÖNGÜSÜ 419
Mekik sistemi (NADH+H+ transferi) 424
TCA ile üre döngüsü arasındaki bağlantı 426
12.5. OKSİDATİF FOSFORİLASYON '.426
Mitokondri transport mekanizmaları 429
Oksidatif fosforilasyon 434
Redoks potansiyeli ve serbest enerji değişiminin hesaplanması 435
Elektron transportunun ATP senteziyle eşleşmesi 445
LİPİD METABOLİZMASI 453
MEMELİLERİN İNCE BAĞIRSAKLARINDA
BESİNSEL
LİPİDLERİN EMİLMELERİ 453
KAN LİPİDLERİ VE LİPEMİ 456
VÜCUT LİPİDLERİ 456
LİPİDLERİN KARACİĞERDE İZLEDİKLERİ YOLLAR 457
YAĞ ASİTLERİNİN METABOLİZMASI 457
Yağ asitlerinin serbest bırakılışı 458
Yağ asitlerinin oksidasyonu 458
Doymamış yağ asitlerinin oksidasyonu 468
Yağ asidi oksidasyonunun düzenlenmesi 468
13.6. KETON CİSİMLERİ VE BİYOKİMYASAL ÖNEMLERİ 468
Keton cisimlerinin sentez yeri 469
Keton cisimlerinin oksidasyonu 471
YAĞLI KARACİĞER VE LİPOTROPİK FAKTÖR 471
YAĞ ASİTLERİMİN SENTEZİ 472
Sitrat transport sistemi 473
Malonil CoA nın oluşması 474
Yağ asitleri sentezinin son basamağı 475
Yağ asidi sentezi ve yıkımlanmasının karşılaştırılması 476
Yağ asitleri sentez safhalarının grup land in İması 476
Yağ asidi sentezinin kontrolü 479
Yağ asidi zincirinin uzaması ve doyurulması 479
13.9. EÎKOZANOİDLER 480
13.10. TRİASİLGLİSEROL VE NÖTRAL LİPİDLER 482
13.11.LİPOPROTEİNLER 482
ASİDİK FOSFOLİPİDLERÎN SENTEZİ 485
ETER LİPİDLERİN SENTEZİ 486
13. 14. SFİNGOLİPİDLER 488
13.15. KOLESTEROL 490
13.15.1. Kolesterol metabolizmasının hücrede bulunan diğer
bileşiklerle olan ilişkisi 493
Patolojik olarak kolesterol birikmesi 495
Aterosklerozis 495
lipid metabolizmasının hormonal kontrolü 495
esansiyel yağ asitleri 496
alkol metabolizması 496
organların
ve dokuların
özel biyokimyasal
fonksiyonları 497
14.1. hücre ve hücre altyapı elemanları 497
14.1.1 Hücre Alt Yapı Elemanlarının Ayrımlanması 499
Hücre çekirdeği 500
Mitokondriuınlar 501
Mikrozom fraksiyonu 502
Lizozomlar 503
14.l.6.Sitoplazma 504
14.1.7.HücreZarı 504
14.1.8. Sİtoiskelet 509
14.2. KAN 510
Kanın içeriği 511
Eritrositler 511
Hemoglobinin Görevleri 515
Eritrosit ve lokosit antijenleri .'....517
Kan plazması 518
Kan pıhtılaşması sistemi 527
14.3. KARACİĞER 530
Ara metabolizmada karaciğer 530
Biotransformasyon reaksiyonları: 531
Kimyasal dönüşümlerle zehirsizleştirme 533
14.3.4.Safra sıvısının oluşumu ve içeriği 534
Karaciğerin patolojik biyokimyası 537
Karaciğer fonksiyon testleri 539
14.4. GIDA MADDELERİNİN ALINMASI, SİNDİRİMİ VE REZORBSİYONU541
Gıda maddeleri ve beslenme 541
Bazal metabolizma 543
Sindirim sekretleri 544
Gıda maddelerinin yi kıl imlan ve rezorpsiyonları 545
intestinal kanalda bakteriyel sindirim ve gaitanın oluşumu 555
14.5. BÖBREKLER VE İDRAR 555
Fonksiyonları 555
Böbreklerin fonksiyonel anatomisi 556
Glomerüler filtrasyon : 558
Böbrek faaliyetlerinin kontrolü ': 560
Böbrek tubulus fonksiyonlarının bozuklukları 561
İdrarın katımı 561
İdrarda patolojik olarak bulunan maddeler 562
İdrar taşlan '. 562
Böbrek fonksiyon testleri ,..564
14.5.10. Ekstrakorporal dializ ve hemoperfüzyon 564
14.6. BAĞ VE DESTEK DOKUSU 565
İnierselüler matriksin proteinleri 566
Kollajen biyosentezi ve sekresyonu 566
Elastin 571
14.6.5. Kemikler 574
14.7. KAS DOKUSU ,577
Miyofıbrillerin fonksiyonel üniteleri (Sarkomer) 579
Miyoflamentlerin moleküler yapısı 579
Kas kontraks iyonların m moleküler mekanizması 582
Uyarılma ve kasılma arasındaki bağlantı 584
Düz kaslar 585
Kas gevşemesinin moleküler mekanizması; relaksiyon 586
Kas hücrelerinde substrat metabolizması 587
Protein deposu olarak kasların görevleri 591
14.8. SİNİR DOKUSU 59 i
Merkezi sinir sisteminin yapı taşları ve içeriği 591
Sinir dokusunda metabolizma 592
Kan-beyin bariyeri ve likör 594
Uyarılma ve uyarımların iletilmesi 595
Nöyrotransmitterler 596
14.9. İMMUN SİSTEM 601
Lenfositler, plazma hücreleri ve makrofajlar 602
Antijenler 605
Antikorlar 606
Antikorlar ve antijenler arasındaki etkileşimler 610
Monoklonal antikorlar 612
Anti viral aşıların üretimi 613
Antiidİotip antikorlar 614
Komplement sistem 614
14.10. TÜMÖR DOKUSU 617
Tümör dokusunun nitelikleri 618
Hücre proliferasyonunun regülasyonu 619
Otokrin sekresyon ve malign transformasyon 620
Hücre proliferasyonunu engelleyici maddeler 622
Tümör oluşumu (Kanserojenez) 622
Kimyasal kanserojenlerin aktivasyonu 624
Kimyasal kanserojenlerin organ ve türe özgü spesifitesi 625
Kimyasal kanserojenler ve onkojenler 625
Kimyasal kanseroj enezde çok aşamalı hipotez 625
Fiziksel kanserojenler 627
Viral Kanserojenler 627
Onkojen aktivasyonunun mekanizması 631
Kromozomal translokasyon ve malign transformasyonu 631
Onkogenin dağılımı 632
Selüler onkojenlerde nokta mutasyonu 634
Tümör dokusunda metabolizma 634
Konakçı organizmada tu mor'ün etkileri 635
Tümör hücrelerinin zarlarındaki değişimler 635
Hormonlara bağlı tümör değişimi 636
Tümör immünolojisi 636
Metastazlar 637
Tümörlerin teşhisi 638
Kanser tedavisi 639
KAYNAKLAR 640
DİZİN 643
«« Fiyatını öğrenmek istiyorum
---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------